L'exceptionnel patrimoine floristique de l'archipel connait différentes menaces. Gwada Botanica porte des projets d'appui aux gestionnaires d'espaces naturels et aux pouvoirs publics pour les aider à mieux lutter contre ces menaces : connaissance des espèces exotiques envahissantes, soutien aux collectivités dans des opérations de restauration, etc.